Caractériser la protéine Spike, qui permet au Covid-19 d’entrer dans nos cellules, est un élément crucial pour améliorer le diagnostic et les perspectives vaccinales. Problème : l’activité des protéines est tributaire de leur structure en trois dimensions, difficile à observer et quasi impossible à calculer ! AlphaFold 2, une IA développée par DeepMind, la filiale de Google, change la donne.
Face au problème du repliement des protéines qui occupe la communauté scientifique depuis près de cinquante ans, elle apporte une solution capable de prédire la forme 3D d’une molécule avec une précision conforme à celle des méthodes expérimentales, plus longues et coûteuses.
Pour cela, DeepMind a utilisé un réseau de neurones basé sur l’attention, capable de se focaliser sur certains éléments tout en considérant l’ordre de la séquence structurant la molécule. Un progrès qui pourrait révolutionner la découverte de médicaments.
